Isenstein gik i privatskole i Berlin og i 1917 blev han optaget på Berlins Kunstakademi, men blev kort efter indkaldt som soldat i 1. verdenskrig. Efter krigen fortsatte han dog studiet, og blev i 1920'erne en aktiv deltager i det berlinske kunstnerliv. Ved Hitlers magtovertagelse i 1933 valgte han med sin familie at flytte til København hvorfra hans mors familie kom. Under 2. verdenskrig måtte han som mange andre jøder flygte til Sverige.[1]
I 1947 blev Isenstein dansk statsborger, og i 1949 blev han ansat som kunstlærer på Bernadotteskolen. Men hans pædagogiske indsats kom dog ikke til at begrænse sig til skolebørn, og han oprettede bl.a. sin egen kunstskole: "Harald Isenstein. Kunstskole".[2]
Isenstein lavede gennem sin karriere adskillige portrætter af kendte mennesker (heriblandt en berømt Albert Einstein buste[3][4] fra 1924),[1] men indrømmede dog villigt, at han foretrak at modellere børn.[5] Isenstein lavede gravmindet til Gretha Vestergaard, offer af bombardementet af Den Franske Skole, som blev emne for podcasten Kiggerpigen. [6]
Harald Isenstein blev også kendt som en aktiv formidler af kunsten gennem sine programmer for Danmarks Radio. I radioen var det programmet Maleklubben som blev bestyret af Isenstein,[7] og parallelt hermed blev programmet også fra 1951 til 1954 gennemført som det første program for børn i fjernsynet, vistnok med titlen Maleklubben udstiller[8]