Københavns Kommune, Frederiksberg Kommune og Bornholms Regionskommune fungerede også som amter. Københavns og Frederiksberg kommuner fordi de historisk har særstatus, mens de bornholmske vælgere ved en folkeafstemning den 29. maj 2001 besluttede at slå de fem bornholmske kommuner og amtskommunen sammen.
Andre områder stod helt uden for den amtslige inddeling. Ertholmene har særstatus ved ikke at indgå i den kommunale inddeling af Danmark.