Stamatys far var græsk, moderen fransk. Fra 1830 studerede han hos Friedrich Kalkbrenner, og blev regnet for hans bedste elev. Fra Kalkbrenner lærte han teknikken med at bruge kraften i fingrene i stedet for underarmene, en teknik Stamaty underviste i senere. Han studerede også hos Felix Mendelssohn i Leipzig i 1836.
Stamaty led af reumatiske lidelser, og hans karriere som pianist var ujævn. I 1837 blev han udnævnt til professor i klaverspil i Paris, og havde talrige elever, blandt andre Camille Saint-Saëns og Louis Moreau Gottschalk.
Stamatys kompositioner er stort set glemt, men enkelte øvestykker for klaver kan stadig købes, framfor alt Le Rhytme des doigts: exercises types à l'aide du métronome, op 36.
