Kong Otto og Dronning Amalies indtog i Athen i 1837.
Som den første dronning i Grækenland havde hun stor indflydelse på, hvordan selskabslivet udformede sig i det nyligt selvstændige land. Dronning Amalie var indledningsvis meget populær. Hendes hovedinteresse var landbruget, hvor hun arbejdede for at begrænse magten hos de tyrkiske storgodsejere. Med tiden mistede hun sin popularitet, da hun forblev protestant, ikke fik børn og begyndte at blive politisk aktiv. Hun blev udsat for et attentatforsøg i 1861. I 1862 blev Kong Otto afsat, og kongeparret forlod Grækenland med et britisk skib.
Senere liv
De boede resten af livet i byen Bamberg i Ottos hjemland, Bayern, hvor Kong Otto døde i 1867. Dronning Amalie overlevede sin mand med næsten otte år og døde i Bamberg den 20. maj1875. Hun blev begravet ved siden af sin mand i Theatinerkirche i München.
