Děj se odehrává v roce 1964 v katolické škole v Bronxu. Ve farnosti působí jako školní kaplancharismatický otec Flynn, který se dostává pro svoje vstřícnější jednání se žáky a větší otevřenost vůči světu do konfliktu s ředitelkou školy, sestrou Aloysius prosazující staré pořádky. Mezi oba přístupy je pak postavena mladá sestra James. Konflikt vrcholí, když sestra Aloysius obviní Flynna ze zneužívání prvního černošského žáka Donalda Mullera. Kněz však odmítá taková podezření s poukazem na to, že mu jen pomáhá v jeho osamocenosti. Aloysius v dobrém úmyslu a zdánlivě sebejistě přinutí kněze farnost opustit, přesto v ní zůstávají pochybnosti o jeho vině i vlastním jednání.
Osoby
sestra Aloysius Beauvierová: matka představená a ředitelka školy sv. Mikuláše; konzervativní, rigidní a mírně cynická.
otec Brendan Flynn: zkušený farář středního věku; pohledný, charismatický a skvělý řečník.
sestra James: mladá jeptiška; velmi snaživá, leč nezkušená učitelka.