Narodil se v Polné nedaleko Jihlavy do rodiny s chorvatským původem.[zdroj?!] Po absolutoriu základní a střední školy vystudoval medicínu, pravděpodobně na Karlo-Ferdinandově univerzitě v Praze. Následně se v Praze usídlil, získal zde měšťanské právo. Zde se stal známým a vyhledávaným porodníkem. Oženil se s Annou Lukeschovou a založil rodinu.
Mikuláš Miksche zemřel v Praze 20. května 1874 ve věku 74 let. Byl pohřben v Nymburce na starém městském hřbitově poblíž kostela svatého Jiří spolu s rodinou své dcery Albíny. Hrob zdobil kamenný náhrobek ve tvaru obelisku s podobiznou Mikuláše Miksche z carrarského mramoru a tesaným nápisem pořízený roku 1878. Jejím autorem je sochařJosef Václav Myslbek. Hřbitov byl v letech 1967–1969 necitelně odstraněn, s výjimkou několika velkých hrobek. Mikschův náhrobní kámen byl spolu s několika dalšími přemístěn do farní zahrady u nymburského kostela svatého Jiljí poblíž náměstí. Náhrobek je od roku 1982 chráněn jako kulturní památka[1].
Rodinný život
S Annou, rozenou Lukeschovou (1815–1898), počali dvě dcery. Starší Albína (1842–1899) se provdala jako Dlabačová a odešla s manželem do Nymburka, je zde pohřbena spolu s otcem. Mladší Anna (1852–1932) se provdala za Jana Lauermanna, vnuka Josefa Jungmanna. Manželství se za dramatických okolností rozpadlo. Anna začala následně psát a publikovat spisy a dramata pod mužským pseudonymem Felix Téver, byla též blízkou přítelkyní spisovatele Julia Zeyera.