JIRA Studio podporuje IDE pro Eclipse, Subversion pro správu revizí, Visual Studio a IntelliJ IDEA. Informace JIRA Studia mohou být zobrazeny v externích systémech pomocí zařízení OpenSocial a k informacím o projektu lze externě přistupovat pomocí Activity Streams.
Pro programový výběr poskytuje JIRA Studio rozhraní API založené na REST a Javě.