Baobab prstnatý je listnatý strom, vysoký 5–25 metrů. Je známý především díky šířce svého kmene, jehož průměr může dosahovat až 14 metrů. Kořeny stromu jsou mnohdy delší než samotný strom, díky čemuž může strom přežít i v suchém klimatu. Od listopadu do prosince vyrůstají na baobabu bílé květy, které jsou velké až 12 cm. Květy mají pět okvětních lístků, které jsou na vnitřní straně chlupaté. V noci květy šíří zápach a jsou opyloványkaloni.
Plody
Plody jsou velké a mají vejcovitý tvar. Když dužina plodu uschne, spadne a rozpadne se na kousky, které poté připomínají kousky tvrdého chleba. Obsahují o 50 % více vápníku než špenát, mají vysoký obsah antioxidantů a třikrát více vitamínu C než pomeranč.