První písemná zmínka o osadě pochází z roku 1805. V roce 1807 vznikla sklárna, kolem níž se rozrostla osada. Ta byla v roce 1808 pojmenována po tehdejším řediteli krumlovského panství, který se jmenoval Arnošt Meyer.[4] Ve sklárně Johanna Blechingera se vyrábělo duté a ploché sklo.[5] Ve sklářské osadě byla postavena rovněž společná pec na chleba. Arnoštov byl součástí schwarzenberského panství a byla zde schwarzenberská myslivna s pokoji pro ubytování vysokých hostí. V roce 1910 zde stálo 21 domů s 318 obyvateli (z toho 313 německými). Po velkých polomech roku 1917 se Arnoštov stal centrem zpracování kalamity,[6] kvůli které zde byla postavena Arnoštovská lesní dráha. V letech 1918–1922 zde byla v provozu parní pila. Provoz sklářské hutě byl za první světové války zastaven a poté byly budovy sklárny využity pro ubytování dřevařů zpracovávajících velké polomy. Provoz obnovil až v roce 1924 majitel sklárny v Chlumu u Třeboně, Václav Hrdina. Definitivně byla uzavřena v roce 1945. Z důvodu vysídlení Němců z Československa přišla osada o většinu obyvatel.
Do 29. dubna 1976 byla obec součástí obce Křišťanov, od 30. dubna 1976 do 31. prosince 1991 spolu s obcí Křišťanov součástí obce Zbytiny a od 1. ledna 1992 je opět místní částí obce Křišťanov.[7]
↑CUŘÍN, František a kolektiv. Jazyk: nářečí, místní jména, slangy. [s.l.]: Jihočeské nakladatelství České Budějovice, 1986. (Jihočeská vlastivěda). Kapitola Místní jména v jižních Čechách, s. 96.
↑BLAU, Josef. Die Glasmacher im Böhmer- und Bayerwald / [1] Die Glasmacher im Böhmer- und Bayerwald in Volkskunde und Kulturgeschichte. Grafenau: Morsak, 1983. ISBN3-87553-206-6. S. 36.
↑KOZÁK, Roman. Zmizelé Čechy - Volarsko. Praha: Paseka, 2006. ISBN80-7185-748-3. Kapitola Okolí Volar, s. 53.
↑Historický lexikon obcí České republiky 1869-2005. II. díl, Abecední přehled obcí a částí obcí v letech 1869-2005. Praha: Český statistický úřad, 2006. 623 s. ISBN80-250-1311-1. S. 25–26.
↑Český statistický úřad. Historický lexikon obcí České republiky 1869–2005. Příprava vydání Balcar, Vladimír; Havel, Radek; Křídlo, Josef; Pavlíková, Marie; Růžková, Jiřina; Šanda, Robert; Škrabal, Josef. 1. vyd. Svazek 1. Praha: Český statistický úřad, 2006. 624 s. ISBN80-250-1311-1. S. 236.