V roce 1931 se konala Mezinárodní koloniální výstava, pro kterou vznikl Palais de la Porte Dorée společně s tropickým akváriem. To mělo představovat vodní faunu tropických zemí a po skončení výstavy zůstalo jako stálá expozice. Akvárium bylo zahrnuto do nově zřízeného muzea kolonií a jeho nástupců. V roce 1985 bylo akvárium renovováno.
Expozice
Akvárium je umístěno v přízemí paláce. Zahrnuje asi 5000 živočichů 350 druhů v akváriích o objemu od 100 do 37 000 litrů. Tyto nádrže jsou rozlišeny tematicky podle druhu ryb nebo biotopu.