Sezóna 1998/1999 byla 6. ročníkem 2. slovenské hokejové ligy. Vítězem se stal tým HK 95 Považská Bystrica, který úspěšně postoupil do baráže o 1. hokejovou ligu, ve které neuspěli. Z 1. ligy sestoupili HK 31 Setra Kežmarok, HK VTJ Vagónka-AŽD Trebišov, HK VTJ Marat Piešťany a ŠHK Danubia 96 Bratislava.

Soutěž byla změněna oproti rozdělena ze tři skupin do jedné kvůli odhlášení několika mužstev. Celkem se jich zúčastnilo 11 týmů, o polovinu miň než z předešlé sezony. Celkem se odehrálo dvacet zápasů (1x venku a doma). Bodový systém byl stejný z předešlé sezony, za výhru se získalo dva body, za remízu jeden bod a za prohru nezískal klub žádný bod. Nejlepší tým ze základní části postoupil do baráže o 1. hokejovou ligu. Ze soutěže se nesestupovalo.

• HK 95 Považská Bystrica - HK VTJ Wagon Slovakia Trebišov 1:2 na zápasy (1:5, 5:1, 3:5)

• Stránky ze sezony 1998/1999 na eliteprospects.com