1599 (MDXCIX) byl rok, který dle gregoriánského kalendáře započal pátkem.

• 3. březen – František z Ditrichštejna se stává kardinálem
• 28. květen – František z Ditrichštejna je zvolen biskupem olomouckým
• konec října – František kardinál z Ditrichštejna přebírá správu olomoucké diecéze
• Tycho Brahe je Rudolfem II. pozván do Prahy
• Zikmund z Ditrichštejna vznesl obvinění ze zlehčování císařského majestátu a zrady proti Karlu staršímu ze Žerotína
• anglická armáda dobyla Cahir, jeden z největších irských hradů
• v Liberci začínají stavět honosnou radnici
• objeveny Pompeje
• Turci dobyli Topoľčany
• Třebíčí se prohnal ničivý požár, který zničil 113 domů.
• první zmínka o pěstování žampionů ve Francii
• Prahu postihla morová epidemie před kterou Rudolf II. utekl do Plzně.

• 1568–1648 – Osmdesátiletá válka
• 1568–1648 – Nizozemská revoluce
• 1585–1604 – Anglo-španělská válka
• 1590–1600 – Povstání Jang Jing-lunga
• 1593–1606 – Dlouhá turecká válka

• 13. února – Alexandr VII., papež († 22. května 1667)
• 13. března – Svatý Jan Berchmans, vlámský jezuita, patron mládeže ( † 13. srpna 1621)
• 22. března – Anthonis van Dyck, vlámský barokní malíř († 9. prosince 1641)
• 23. března – Thomas Selle, německý barokní skladatel († 2. července 1663)
• 25. dubna – Oliver Cromwell, anglický lord protektor († 3. září 1658)
• 1. června – Alžběta Lukrécie Těšínská, těšínská kněžna († 19. května 1653)
• 6. června – Diego Velázquez, španělský malíř († 6. srpna 1660)
• 20. září – Kristián Brunšvický, halberstadtský luteránský biskup, vévoda brunšvicko-wolfenbüttelský, vojevůdce († 16. června 1626)
• 25. září – Francesco Borromini, italský architekt († 3. srpna 1667)
• 27. září – Robert Blake, britský admirál († 17. srpna 1657)
• 28. října – Marie od Vtělení Guyart, francouzská katolická světice († 30. dubna 1672)
• 11. listopadu
  • Ottavio Piccolomini italský generál, velitel tělesné stráže Albrechta z Valdštejna († 11. srpna 1656)
  • Marie Eleonora Braniborská, švédská královna († 18. května 1655)
• ? – Stefan Czarniecki, polský generál († 16. února 1665)
• ? – Mao Ťin, čínský nakladatel a spisovatel († 1659)

Česko

• 18. října – Daniel Adam z Veleslavína, český spisovatel a vydavatel (* 31. srpna 1546)
• ? – Brikcí z Cimperka, pražský zvonař (* 1535)

Svět

• 13. ledna – Edmund Spenser, anglický básník (* přibližně 1552)
• 22. února – García Loaysa y Girón, arcibiskup toledský (* 1534)
• 10. dubna – Gabriella d'Estrées, milenka, důvěrnice a snoubenka francouzského krále Jindřicha IV. (* 1570)
• 27. dubna – Tošiie Maeda, japonský generál 16. stol. (* 15. ledna 1539)
• 5. června – Josua Maaler, švýcarský farář a lexikograf (15. června 1529)
• 11. července – Motočika Čósokabe, japonský daimjó období Sengoku (* ? 1538)
• 4. listopadu – Pedro da Fonseca, portugalský teolog a filozof (* 1528)
• 29. prosince – Valerio Cigoli, italský renesanční sochař (* 1529)
• ? – Rumold Mercator, vlámský kartograf (* 1545)

• České království – Rudolf II.
• Svatá říše římská – Rudolf II.
• Rakouské arcivévodství – Rudolf II.
• Papež – Klement VIII.
• Anglické království – Alžběta I.
• Francouzské království – Jindřich IV.
• Polské království – Zikmund III. Vasa
• Uherské království – Rudolf II.
• Švédské království – Zikmund I. Vasa – Karel IX.
• Dánské království – Kristián IV.
• Neapolské království – Filip II. Španělský
• Rusko – Boris Godunov
• Osmanská říše – Mehmed III.
• Perská říše – Abbás I. Veliký

• Obrázky, zvuky či videa k tématu 1599 na Wikimedia Commons