Actualment, Montpeller té tres universitats hereues de la pionera i amb diverses escoles politècniques superiors, públiques i privades. Tanmateix, es troba a esborrany (2009) el projecte per unificar els campus en una gran universitat.
Universitat Montpeller I
Està localitzada al centre de la Regió Llenguadoc-Rosselló, va ser fundada el 1289. Aproximadament amb 26.000 estudiants. li ha correspost el maneig de les àrees del saber que representen les seves facultats o Unitats de Formació i Investigació (UFR).
Encarregada de les àrees tècniques i tecnològiques, té prop de 50 laboratoris que es reagrupen en 10 departaments d'investigació, on treballen més de 2.500 persones.
Hi participen també més de 15.000 estudiants en 7 unitats:
Unitat de Formació en Investigació de les Ciències (Facultat de Ciències)
Institut Universitari de Formació de Mestratges (IUFM)
3 Instituts Universitaris de Tecnologia
IUT de Montpeller
IUT de Nîmes
IUT de Besiers que ofereixen 13 especialitats
Escola Politècnica Universitària de Montpeller (l'Ecole Polytechnique Universitaire de Montpeller - POLYTECH'M)
Institut de competències científiques i d'administració (l'Institut d'Administration des Empreses-IAE)
Universitat Montpeller III
Universitat Montpeller III també anomenada Universitat Paul-Valéry, amb campus universitaris a Montpeller i en Beziers té prop de 16.000 estudiants (el 2008). Ofereix llicenciatures, llicenciatures professionals i màsters, a més de múltiples convenis de formació amb universitats de diverses nacionalitats.