Va ser fundada el 1887 pel pare jesuïta Joseph Cataldo, S.J., que volia crear una universitat jesuïta al nord-oest dels Estats Units. El campus inclou 94 edificis en els 131 acres (437,000 m²) que ocupa la universitat al llarg del llit del riu Spokane, en una zona residencial dels afores de Spokane. La Universitat Gonzaga competeix en la Divisió I de la NCAA, en la West Coast Conference. Un dels seus jugadors més destacats en la NBA va ser John Stockton, ex-jugador dels Utah Jazz.