L'aparició de la URNG va suposar una gran avançament en la lluita revolucionària però la cúpula militar de l'exèrcit de Guatemala va utilitzar-lo per poder utilitzar una major repressió amb el menor cost polític possible.
El 1999 va presentar-se a les eleccions en una coalició amb altres partits menors d'esquerres, aconseguint el tercer lloc, però el 2003, després de presentar-se per separat, la URNG va aconseguir uns pèssims resultats amb tan sols dos diputats al parlament guatemalenc.