Sofia Amàlia era molt amant de la caça i, tot i la difícil situació financera del regne, va ser el centre de la sumptuosa vida de la Cort. Li agradava la moda, les festes i el teatre, i va introduir el gust de la moda francesa a Dinamarca. Ella mateixa, amb els seus fills participava de les representacions teatrals. La sumptuositat de la Cort en un país empobrit va causar malestar entre la població.
En la primera part del regnat de Frederic III, i més tard durant el regnat del seu fill Cristià V, va tenir una notable influència en les decisions polítiques, amb la voluntat d'introduir-hi una monarquia absoluta. Va tenir un paper destacat en la guerra contra Suècia el 1657, i va aconseguir una gran popularitat pel suport moral que la reina oferí durant el setge de Copenhaguen entre 1658 i 1660. Va tenir unes relacions difícils amb la família del seu marit, amb una gran ambició per a situar adequadament les seves filles. Un cop vídua es va retirar al seu palau d'Amalienborg construït entre 1669 i 1673.
