Sant Joan de Salelles és una població del municipi baixempordanès de Cruïlles, Monells i Sant Sadurní de l'Heura. El 2005 tenia 19 habitants.
Ja formava part de l'antic municipi de Cruïlles quan el 1974 es va formar l'actual municipi per fusió de tres d'anteriors.[1]
El seu edifici més important és l'església romànica de Sant Joan de Salelles.