El districte de Sükhbaatar s'hi troba a la part més septentrional de la província de Selenge, a la part nord de Mongòlia, llindant amb Rússia. Pel districte s'unixen els rius Selenge i Orkhon, que van a desembocar al llac Baikal. El districte de Sükhbaatar limita amb Rússia cap al nord i amb els districtes d'Altanbulag a l'est, Shaamar al sud i Züünbüren a l'oest. Sükhbaatar té un clima continental d'estius càlids i hiverns secs amb mitjanes màximes anuals de 26,9 graus celsius al juliol i mínimes de 27,5 graus sota zero al gener; el mes amb més precipitacions és l'agost, amb 69,9 mil·límetres.[2]
