Un morfogen és una substància que regeix els patrons naturals del creixement dels teixits dins el procés de la morfogènesi i les posicions de diversos tipus de cèl·lules especialitzades dins d'un teixit. Més precisament, un morfogen és una molècula assenyaladora que actua directament sobre cèl·lules per a produir respostes cel·lulars específiques depenent de la seva concentració en el lloc.