Era fill del fundador de la companyia Seguin et Cie Marc François Seguin i de Thérèse-Augustine de Montgolfier, era descendent dels germans Montgolfier. Es va casar el 1813 amb Augustine Duret, i van tenir tretze fills. Enviudà el 1837, es va tornar a casar el 1839 amb Augustine de Montgolfier, i van tenir 6 fills més.
Participà amb els seus germans Camille, Jules, Valentin i Charles, en la construcció d'un gran nombre d'obres[1] (65 identificades) a França, però també a Itàlia i Espanya.
Va construir un pont suspès a París el 1828, la passera de la Grève, (a l'emplaçament de l'actual pont d'Arcole, destruït el 1854. Estigué en l'origen del ferrocarril Lyon-Saint-Étienne, el segon que es va construir a França. Sobre aquesta línia van circular les locomotores Seguin, construïdes per Marc Seguin sobre la base de les locomotores de George Stephenson. La seva primera locomotora circulà el primer d'octubre de 1829.
De l'influence des chemins de fer et de l'art de les tracer et de les construire, Carilian-Gœury et V. Dalmont, Paris, 1839 OCLC458773928, réimpression en 1887 (lire en ligne).
Mémoire sur la navigation à vapeur, lu à l'Institut, le 26 décembre 1826, Bachelier, Paris, 1828, 29, in-4°, (lire en ligne.
Mécanique industrielle. Mémoire sur un nouveau système de moteur fonctionnant toujours avec la même vapeur, à laquelle on restitue, à chaque coup de piston, la chaleur qu’elle a perdue en produisant l'effet mécanique, Paris, Mallet-Bachelier, 1857, 17, fig., in-4°, .
Mémoire sur l'origine et la propagation de la force, Mallet-Bachelier, Paris, 1857 (lire en ligne)
Michel Cotte, L'approche mathématique du pont suspendu chez Marc Seguin, 1822-1826, p. 233-257, Revue d'histoire des sciences, année 1993, volume 46, (lire en ligne)