Isidor de Milet el Jove (en llatí Isidorus, en grec antic Ἰσίδωρος) fou un eminent arquitecte de la ciutat de Milet que va viure a la meitat del segle vi.
Era nebot d'Isidor de Milet el Vell. Va reconstruir la cúpula i una part de la gran església de Santa Sofia de Constantinoble que havia estat damnada per un terratrèmol el 7 de maig de 558 i va fer alguns afegits a l'interior de l'església. En parlen Procopi i Agàties.[1]