Les seves tasques de cooperació es realitzaven per mitjà de comissions mixtes integrades per Espanya i els països iberoamericans en el marc dels programes derivats de les Cimeres Iberoamericanes. L'ICI comprenia tres subdireccions: Mèxic, Amèrica Central i el Carib; Amèrica del Sud; Cooperació Institucional, Cultural i de Comunicació. A Amèrica, l'ICI va arribar a comptar amb 20 oficines de cooperació, 18 centres culturals i tres centres de formació.
El novembre de 1988, l'ICI es va transformar en AECI (Agència Espanyola de Cooperació Internacional), traspassant les seves funcions i infraestructures. En 2007, l'AECI es va convertir al seu torn en una agència estatal i va incorporar al seu nom la paraula Desenvolupament, passant a ser Agència Espanyola de Cooperació Internacional per al Desenvolupament (AECID). Actualment, l'AECID és el principal instrument de cooperació exterior oficial d'Espanya.