El 15 de juliol de 1915 es casà amb Hilla-Brita Trolle, filla del baró Nils Axel Arvid Trolle i la baronessa Anna Eleonora Sofia Leijonhufvud.[3] El seu fill Hans von Blixen-Finecke Jr. guanyà dues medalles d'or als Jocs Olímpics de Hèlsinki de 1952.[1][2] Hans von Blixen-Finecke Sr. morí en un accident d'avió que va tenir lloc el 26 de setembre de 1917 i fou enterrat al cementiri de Gärdslöv, a Trelleborg.[4]