El Govern de Hokkaidō (en japonés: 北海道庁, Hokkaidô Chô) és el cos executiu de Hokkaido. El seu actual cap és el governador Naomichi Suzuki.
Història
1869: S'estableix l'Oficina de Colonització de Hokkaidō, nomenant Hokkaido amb el seu nom actual. Es divideix el territori en 11 províncies i 86 districtes.
1882: S'aboleix l'oficina de colonització i abolició de les tres prefectures que fins llavors es trobaven al territori: Sapporo, Hakodate i Nemuro.
1886: S'unifiquen les tres prefectures en una i es funda el Govern d'Hokkaido.
1888: L'antic edifici roig d'estil occidental seu del govern és acabat.
1897: Es promulga el sistema de pobles de primera y segona classe, amb el sistem del districte de Hokkaido.
1923: Abolició completa del sistema unificat de govern a Hokkaido i cumpliment del sistema de pobles i aldees amb 6 ciutats, 99 pobles de primera classe i 155 pobles i aldees de segona classe en aquell moment.
1947: Amb l'aprovació de la llei d'entitats locals del Govern de la Prefectura es torna a obrir i torna a exercir com un govern prefectural normal.