El gener de 1922 fou nomenat president del RCD Espanyol, mentre que el seu germà Manuel Fernández Muñiz fou escollit com a vicepresident primer.[1][2][3] A nivell esportiu, l'equip va tenir una mala temporada, havent de disputar la promoció de descens amb el FC Espanya, salvant finalment la categoria.[1] Al cap de sis mesos, el més de juny, Victorià de la Riva el substituí a la presidència, mentre que Eusebio i el seu germà esdevingueren vicepresidents.[1]
A nivell professional, Eusebio Fernández fou representant de l'empresa automobilística Hispano Suïssa a la Barcelona dels anys vint.[4][1] Els colors de la bandera d'Avilés i del club de futbol Stadium Avilesino foren inspirants en els colors del RCD Espanyol.[4] Eusebio Fernández s'havia traslladat a Avilés el 1924, on entrà a la directiva del club local. Eusebio gestionà la compra d'unes samarretes, portades des de Barcelona, amb els colors blanc i blau.[4][1] El juliol de 1932 també fou president de l'Stadium Avilesino.[1]