La primera EUMM va començar a funcionar el juliol de 1991 després de l'acord de Brioni sota el nom d'ECMM (European Community Monitor Mission). La missió va ser finançada per la Comissió Europea i estava formada per 75 especialistes sobre el terreny. La missió tenia la seva seu a Zagreb i la seva àrea designada incloïa Bòsnia i Hercegovina, Croàcia, Sèrbia, Montenegro, Albània i l'actual Macedònia del Nord. L'ECMM va passar a denominar-se Missió de Seguiment de la Unió Europea el 22 de desembre de 2000.[2]
El gener de 1992, la missió es va suspendre breument després de la caiguda d'un helicòpterAB-205 de l'Exèrcit Italià el 7 de gener de 1992 vora Podrute (Novi Marof), i hi moriren cinc observadors (quatre italians : Silvano Natale, Fiorenzo Ramacci, Enzo Venturini, Marco Matta[3] i un francès: Jean-Loup Eychenne)[4][3][5] L'helicòpter fou tocat "per error" pels trets de coets i canons d'un MiG-21 de l'exèrcit aeri iugoslau.[6][7]
En maig de 1992 els soldats de l'Exèrcit Federal Iugoslau mataren el comandant belga Bertrand Borrey vora Mostar (Bòsnia i Hercegovina).[6][8] L'assistent del cap dels observadors de la missió fou trobat defenestrat el 1997. Segons els familiars de la víctima citats per A. Dumoulin i N. Gros-Verheyde, podria ser un assassinat pels serveis serbis i maquillat en suïcidi.[6]
L'EUMM Iugoslàvia va acabar el 31 de desembre de 2007.
