A la fi del segle xviii el "Port San Carlos", va rebre aquest nom en honor del rei Carles III d'Espanya, qui va governar de 1759 a 1788. En 1807, el port de San Carlos figura inclòs com a poble del partit de San Alejo. Va ingressar el 12 de juny de 1824, en el Departament de San Miguel.
El 13 de juliol de 1824, el port de San Carlos va ser habilitat, per l'Assemblea Nacional Constituent de les Províncies Unides del Centre d'Amèrica, en concepte de "Puerto Mayor" amb el nom de Port de la Unió Centreamericana.
El 28 de febrer de 1865 es va atorgar al poble de San Carlos de la Unió el títol de Ciutat. El 22 de juny de 1865, per D. I en l'administració de Francisco Dueñas, s'erigeix el departament de la Unió.
Francisco Dueñas va dividir l'antic i gran departament de San Miguel en tres: el d'aquest nom, el d'Usulután i el de la Unió, format aquest últim pels districtes de la Unió, i el de San Antonio del Sauce (avui Santa Rosa de Lima), a partir del 3 de febrer de 1881, durant l'administració de Rafael Zaldívar, es crea el districte de Santa Rosa de Lima.