La població indígena total del departament és de 3.591 persones. En el seu territori hi ha 26 resguardos en una àrea de 128.167 hectàrees. Allí viuen 6 pobles indígenes: U'wa, (1.124), betoye (800), sikuani (782), hitnü (441), Kuiba (241), chiricoa, (173) i piapoco (30).