La segona fase de la Copa del Món de Futbol de 1966 va ser la fase final de la competició, disputada a Anglaterra, després de la fase de grups. Dos equips de cada grup (8 en total) es classificaven per la segona fase, disputada a eliminació directa.
Equips classificats
Els vuit equips classificats per les semifinals van ser:
Quadre
Quarts de final
Anglaterra vs Argentina
Alemanya Occidental vs Uruguai
Unió Soviètica vs Hongria
Portugal vs Corea del Nord
Semifinals
Alemanya Occidental vs Unió Soviètica
Anglaterra vs Portugal
Tercer lloc
Final