El Club América va ser fundat el 12 d'octubre de 1916 a Mèxic, per iniciativa d'un grup d'escolars mexicans, al capdavant dels quals estava Rafael Garza Gutiérrez"Record" i Ignacio "Nacho" de la Garza. L'adopció del nom América va ser el resultat de la coincidència que va tenir la data de fundació amb la commemoració del descobriment d'Amèrica per Cristòfol Colom. Fou el resultat de la fusió d'un parell d'equips de col·legis maristes, el Rècord i el Colón. Entre 1918 i 1920 va prendre el nom de Centro Unión, però el 1920 l'equip torna a reprendre el nom de Club América. Entrà a la Lliga Amateur del Districte Federal on assolí el seu primer títol el 1925, d'un total de 4.
L'equip América fou un dels equips fundadors de la primera divisió de Mèxic el 1943. El 1959, el club és adquirit per Emilio Azcárraga Milmo, fill d'Emilio Azcárraga Vidaurreta propietari de Telesistema Mexicano l'empresa que avui dia és Televisa. Aquests anys comença a rebre els sobrenoms de Los Canarios, pel seu uniforme, i Los Millonetas pels seus propietaris. Els anys 1970 es comença a albirar l'equip gran que més tard esdevindrà. Va inaugurar la dècada obtenint el primer campionat nacional. En aquesta dècada destacaren els jugadors Carlos Reinoso i Enrique Borja. En els 70 l'América va obtenir 2 campionats i la primera Copa Interamericana. América va ser l'equip amb més títols guanyats en els anys 1980 a Mèxic, obtenint 5 campionats de lliga durant aquest període. En aquesta època adquirí el malnom de Águilas (que sonava millor que canaris).
L'América va caure en una època grisa que va durar des de 1988-89 fins al torneig d'Hivern 2001 on no van guanyar un sol títol de Lliga. No obstant això, en aquesta època les àguiles van obtenir dos títols de la Copa de Campions de la CONCACAF: el 1991, i 1993. També el 1991 van obtenir la Copa Interamericana. Aquests anys van destacar jugadors com Antonio Carlos Santos, Gonzalo Farfán, Adrián Chávez, Luis Roberto Alves "Zague" i Cuauhtémoc Blanco.
Amb l'arribada del nou segle, les àguiles van tornar a ser campions en el torneig d'Estiu 2002, el seu primer títol de Lliga en 13 anys. Simultàniament, l'América va assolir arribar fins a les semifinals de la Copa Libertadores de 2002 on van ser eliminats per l'AD São Caetano de Brasil. En el torneig de Clausura 2005 aconsegueix el seu desè títol en l'era professional. El 26 de maig de 2013 va aconseguir el seu onzè títol en l'era professional abans guanyar a Cruz Azul 4-2 en penales
↑Héctor Villa Martínez, Macario Reyes Padilla y Emmanuel Castro Serna. «México - List of Cup Winners» (en anglès). Rec.Sport.Soccer Statistics Foundation (RSSSF), 2003. [Consulta: 8 maig 2008].
↑Jim Goloboy, Erik Francisco Lugo y Karel Stokkermans. «CONCACAF Cup» (en anglès). Rec.Sport.Soccer Statistics Foundation (RSSSF), 2008. [Consulta: 8 maig 2008].
↑James Goloboy. «FC Giants' Cup 2001». Rec.Sport.Soccer Statistics Foundation (RSSSF), 2007. [Consulta: 5 maig 2008].
↑Osvaldo José Gorgazzi and Karel Stokkermans. «Copa Interamericana» (en anglès). Rec.Sport.Soccer Statistics Foundation (RSSSF), 2006. [Consulta: 8 maig 2008].