Esquema de la classificació de Baltimore amb les "vies" que utilitza cada grup de virus per a sintetitzar l'ARNm.
La classificació dels virus consisteix a situar i ordenar taxonòmicament els virus . Com ja succeeix en els organismes més petits la classificació no és gens fà cil. En el cas dels virus la classificació encara és més costosa, ja que els virus, estrictament, no se'ls pot considerar éssers vius, ni tampoc absolutament éssers inerts. A més a més, la seva possible classificació és impossible de compatibilitzar amb la classificació tradicional dels organismes cel·lulars. Per aquestes raons, la classificació vÃrica és avui dia tema de debat i discussió entre diferents idees i propostes, que tenen en compte uns o altres criteris. Els criteris més importants a l'hora de classificar són carà cters fenotÃpics, però no exclusivament. Els principals són els següents: morfologia, tipus d'à cid nucleic emprat per a guardar la informació genètica, mode de replicació, tipus d'hoste i alteracions que provoquen en aquest. Els criteris reals utilitzats varien segons el tà xon i poden ser incoherents (llindars de semblança arbitraris) o, de vegades, aliens a la lÃnia (geografia).[ 1] La qüestió, per a molts, encara no està resolta.[ 2]
El 1982, l'ICTV (Comitè Internacional de Taxonomia de Virus ) va començar a definir una espècie com "un cúmul de soques" amb qualitats identificatives úniques. El 1991, es va adoptar el principi més especÃfic que consisteix en el fet que una espècie de virus és una classe de virus que comparteixen un gran nombre de caracterÃstiques, que constitueix un llinatge replicant i que ocupa un nÃnxol ecològic particular.[ 2] Al juliol de 2013, la definició de l'ICTV d'espècies va canviar més per un tipus d'estat: "Una espècie és un grup monofilètic de virus les propietats de les quals es poden distingir de les d'altres espècies per múltiples criteris."[ 3] Els virus són entitats fÃsiques reals produïdes per l'evolució biològica i la genètica, mentre que les espècies de virus i els tà xons superiors són conceptes abstractes produïts pel pensament racional i la lògica . La relació virus-espècie representa, per tant, la primera lÃnia de la interfÃcie entre la biologia i la lògica.[ 4]
Les dues classificacions més acceptades són la classificació de Baltimore i la classificació de l'ICTV.
Classificació de Baltimore
Classificació de Baltimore dels virus, basada en l'obtenció de l'ARNm a partir del genoma del virus. Les classes III-VII són virus d'ARN.
Aquest sistema va ser ideat pel biòleg David Baltimore , guanyador del Premi Nobel De Medicina de 1975. El sistema es basa en la manera en què els virus tenen la informació genètica, i els divideix en els set grups següents, que s'anomenen amb nombres romans.[ 5] [ 6]
Visualització dels set grups de virus d'acord amb la classificació de Baltimore
Classificació de l'ICTV
L'ICTV és el Comitè Internacional de Taxonomia de Virus . Va ser ideat per implementar una normativa que classifiqués virus als principis dels anys noranta. Segons l'ICTV els virus es classifiquen de la manera següent:[ 7]
Ordre (-virales )
FamÃlia (-viridae )
SubfamÃlia (-virinae )
Gènere (-virus )
Espècie (-virus )
Com s'aprecia, aquest model segueix l'estructura de l'esquema de tà xon .
El tà xon d'ordre és molt nou i encara no s'ha definit amb prou claredat, i per això fins al moment només se n'han definit tres. El tà xon famÃlia està format per 80 famÃlies que encara no estan del tot ben classificades. El total d'espècies de virus conegudes és aproximadament 4.000.
Classificació vÃrica
Virus d'ADN
Virus d'ARN
FamÃlia
Gènere
Presència de cà psida (SÃ/No)
Tipus de cà psida
Tipus de material genètic
1.Reoviridae
Reovirus , Rotavirus
No
Icosaèdrica
Doble cadena
2.Picornaviridae
Virus de la pòlio , Rhinovirus , virus de l'hepatitis A
No
Icosaèdrica
Cadena simple
3.Caliciviridae
Norovirus , virus de l'hepatitis E
No
Icosaèdrica
Cadena simple
4.Togaviridae
Virus de la rubèola
SÃ
Icosaèdrica
Cadena simple
5.Arenaviridae
Virus de la coriomeningitis limfocÃtica
SÃ
Complexa
Cadena simple
6.Retroviridae
VIH
SÃ
Complexa
Cadena simple
7.Flaviviridae
virus del dengue , virus de l'hepatitis C , virus de la febre groga
SÃ
Complexa
Cadena simple
8.Ortomixoviridae
Virus de la grip
SÃ
Helicoide
Cadena simple
9.Paramixoviridae
Virus del xarampió , virus de la parotiditis , virus sincitial respiratori
SÃ
Helicoide
Cadena simple
10.Buniaviridae
Virus de l'encefalitis de Califòrnia , Hantavirus
SÃ
Helicoide
Cadena simple
11.Rabdoviridae
Virus de la rà bia
SÃ
Helicoide
Cadena simple
12.Filoviridae
Virus d'Ebola , Marburgvirus
SÃ
Helicoide
Cadena simple
13.Coronaviridae
Coronavirus
SÃ
Complexa
Cadena simple
14.Astroviridae
Astrovirus
No
Icosaèdrica
Cadena simple
15.Bornaviridae
Bornavirus
SÃ
Helicoide
Cadena simple
Referències
↑ Peterson , A Townsend «Defining viral species: making taxonomy useful». Virology Journal , 11, 1, 23-07-2014. DOI : 10.1186/1743-422X-11-131 . PMC : 4222810 . PMID : 25055940 .
↑ 2,0 2,1 Alimpiev , Egor. Rethinking the Virus Species Concept , 15 març 2019.
↑ «Recently agreed changes to the International Code of Virus Classification and Nomenclature». Archives of Virology , 158, 12, 12-2013, pà g. 2633–9. DOI : 10.1007/s00705-013-1749-9 . PMID : 23836393 .
↑ «International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) » (en anglès). Arxivat de l'original el 2019-04-03. [Consulta: 25 març 2020].
↑ Baltimore D «Expression of animal virus genomes ». Bacteriol Rev , 35, 3, 1971, pà g. 235–41. PMC : 378387 . PMID : 4329869 .
↑ Mahmoudabadi, Gita, and Rob Phillips. A comprehensive and quantitative exploration of thousands of viral genomes . eLife 7 (2018): e31955.
↑ «ICTV Code ». International Committee on Taxonomy of Viruses. Arxivat de l'original el 12 de juliol 2018. [Consulta: 26 abril 2020].
Enllaços externs