Funes realitzà els estudis de primària i secundària al Col·legi Externado San José, i es llicencià en Lletres a la Universidad Centroamericana José Simeón Cañas (UCA).[1] L'any 1986 va començar la seva pràctica periodística com a reporter del Noticiero Tele 10, programa de la televisió estatal Canal 10. Des de 1987, i per un període de quatre anys, va treballar a Al Día, espai informatiu de Canal 12, tenint sota la seva responsabilitat la font parlamentària (cobertura de l'Assemblea Legislativa).
El 10 d'octubre de 2007, Alejandro Funes, fill primogènit de Mauricio Funes, va morir a França. Segons fonts policíaques parisenques, el jove de 27 anys fou atacat per un home d'origen marroquí als afores del Museu del Louvre. Alejandro Funes estava estudiant fotografia a París.[2]
President d'El Salvador
Es convertí en el primer president d'esquerres del país, després de guanyar en les eleccions presidencials d'El Salvador de 2009 amb un 51,3% dels vots al candidat d'ARENA, Rodrigo Ávila.[3]
El novembre de 2009, el president Funes va haver d'afrontar el desastre natural que va afectar molt les comunitats de Cuscatlán, San Salvador i San Vicente com a conseqüència de la pluja provocada per l'huracà Ida.[4]