L'arxidiòcesi fou erigida el 22 de gener de 1966 mitjançant la butllaQuam verae del papa Pau VI, prenent el territori dels bisbats de Juneau i de Fairbanks.
El 28 d'abril de 1967, mitjançant la carta apostòlicaPraestans opificum, el papa Pau VI proclamà Sant Josep Obrer com a patró principal de l'arxidiòcesi.[3]
Abans de la unió, el territori s'estenia sobre 223.674 km² i estava dividit en 23 parròquies.
El 22 de gener de 1966 cedí una porció de territori a benefici de l'erecció de l'arquebisbat d'Anchorage, de la qual es va convertir en sufragània.
Abans de la unió, el territori s'estenia sobre 97.258 km² ² i estava dividit en 9 parròquies.
Arquebisbat d'Anchorage-Juneau
El 7 de juny de 2019 el bisbe de Juneau Andrew Eugene Bellisario va ser nomenat administrador apostòlic de l'arquebisbat d'Anchorage.
El 19 de maig de 2020 l'arquebisbat d'Anchorage i el bisbat de Juneau van ser unides pel papa Francesc amb la butlla Demandatum nobis; contextualment la nova circumscripció assumí el nom actuale.[4]
L'escut de la nova arxidiòcesi, "... inclou elements dels escuts de les diòcesis anteriors. La línia horitzontal del centre representa l'horitzó que separa la terra del cel, i les línies ondulades del fons, preses de l'escut de Juneau, representen l'aigua sota la cúpula del cel. Totes elles representen la bellesa de la creació a l'arxidiòcesi, habitada per primera vegada pels pobles nadius d'Alaska. Els elements sobre la línia de l'horitzó també es prenen de l'escut de Juneau. La constel·lació de l'Ossa Major amb l'Estrella Polar recorda la bandera d'Alaska i representa l'Estat d'Alaska. L'Estrella Polar, que ha guiat i inspirat Alaska des dels primers dies, també representa la Santíssima Mare de Déu, “l'Estel del mar". La mitja lluna representa la Nativitat de la Santíssima Mare de Déu i la primera i més antiga catedral catòlica d'Alaska, situada a la capital Juneau. L'àncora de tres puntes, extreta de l'escut de l'arxidiòcesi d'Anchorage, representa la virtut de l'esperança, la Santíssima Trinitat i el municipi d'Anchorage, el més gran d'Alaska. "[6]
Escut de l'antiga diòcesi de Juneau
Escut de l'antiga arxidiòcesi d'Anchorage
Estadístiques
A finals del 2020, la diòcesi tenia 55.297 batejats sobre una població de 563.372 persones, equivalent al 9,8% del total.