L'Armada taiwanesa té com a principal missió defensar el territori marítim de la República de la Xina d'atacs marítims, atacs aeris o una possible invasió per part de la República Popular de la Xina. Les seves tasques en temps de pau són la protecció de Taiwan i la vigilància de les aigües territorials. En temps de guerra les seves tasques són les operacions de contraatac i lluitar contra les invasions. L'Armada de la República de la Xina disposa d'un cos d'Infanteria de marina que pot fer desembarcaments.
Història
Després de l'evacuació del Govern de la República de la Xina a l'illa de Formosa (Taiwan), l'armada taiwanesa va participar en l'escorta, el transport, i l'evacuació dels soldats, i els refugiats civils desplaçats, també va organitzar patrulles navals, i va portar a terme operacions de subministrament a les tropes destacades a les Illes de Kinmen, i Matsu, navegant per l'Estret de Formosa i el Mar del Sud de la Xina, i les Illes Pescadors.
Segle XXI
La doctrina militar de l'Armada taiwanesa és contrarestar qualsevol intent de bloqueig naval per part de les forces navals de la República Popular de la Xina, així com evitar un possible enfrontament a les costes de Taiwan. L'armada taiwanesa ha estat treballant de valent per expandir la seva capacitat en el camp de l'electrònica, i en el camp de la guerra anti-submarina, alhora que s'ha reemplaçat alguns vaixells antics de la flota. Tanmateix, a la indústria naval taiwanesa li manca encara la tecnologia per a construir els seus propis submarins de combat.