Fill de Jean-André Thouin (mort el 1764), intendent del Jardí Reial de les Plantes Medicinals i germà del paisatgista Gabriel Thouin (1747-1829), André va estudiar botànica amb Bernard de Jussieu (1699-1777). Buffon (1707-1788) li ofereix la plaça que ocupava el seu pare Jean-André i André augmentà molt el nombre de plantes i de cultius fins a 6.000 plantes vives a la seva mort.
Col·laborà a l'Enciclopèdia francesa. Va ser membre de la Société d'Agriculture en 1784, membre de l'Académie des Sciences el 1786, i de 72 acadèmies més.
Amb el botànic René Desfontaines (1750-1831), va fer l'inventari dels jardins botànics al voltant de París.
Georges Cuvier (1769-1832) va pronunciar el seu elogi davant l'Institut.[1]
La seva signatura com a botànic és Thouin.
Publicacions
Essai sur l'exposition et la division méthodique de l'économie rurale, sur la manière d'étudier cette science par principes et sur les moyens de... la perfectionner, Paris : Impr. de Marchant, 1805, in-4°, 56 p.
Description de l'école d'agriculture pratique du Muséum d'histoire naturelle, Paris, 1814, in-4°
Manuel d'arboriculture. Manuel illustré de la culture, de la taille et de la greffe des arbres fruitiers
Monographie des greffes, ou Description technique des diverses sortes de greffes employées pour la multiplication des végétaux, 1821
Instruction pour les voyageurs et pour les employés dans les colonies sur la manière de recueillir, de conserver et d'envoyer les objets d'histoire naturelle, rédigée... par l'administration du Muséum royal d'histoire naturelle, 1824
Cours de culture et de naturalisation des végétaux, Paris : Mme Huzard et Déterville, 1827, 3 vol. in-8°, 1662 p. avec tableaux, un atlas in-4° de 65 planches gravées en taille-douce
nombreuses collaborations sous forme d'articles, ainsi dans l'Encyclopédie méthodique (section d’Agriculture), dans le Supplément de Rozier, dans les Mémoires de la Société d'agriculture, dans la Feuille du Cultivateur, la Bibliothèque physico-économique, dans le Dictionnaire d'histoire naturelle et le Nouveau Cours d'agriculture, deux ouvrages publiés par Déterville, dans les Annales de l'Agriculture françoise, ou encore dans les Annales et Mémoires du Muséum d'histoire naturelle;
son neveu Oscar Leclerc-Thoüin publie, en 1827, son Cours de culture et de naturalisation des végétaux, 3 vol. in-8° et atlas in-4°.
Nouvelle Biographie générale, 1866, t. 45, c. 264-266
Adrien Davy de Virville (dir.), Histoire de la botanique en France, Paris : Sedes, 1955, 394 p.
Florian Reynaud, Les bêtes à cornes (ou l'élevage bovin) dans la littérature agronomique de 1700 à 1850, Caen, thèse de doctorat en histoire, 2009, annexe 2 (publications) et annexe 22 (biographie) ressources en ligneArxivat 2021-03-07 a Wayback Machine.
Yvonne Letouzey, Le Jardin des plantes à la croisée des chemins avec André Thouin, 1747-1824, Paris : Muséum national d'histoire naturelle de Paris, 1989, 678 p. ISBN 2-85653-174-1