La croada albigesa es va proclamar el 1208 després de l'assassinat del legat papal Pere de Castellnou. Aquesta guerra va servir de pretext per a la invasió del Llenguadoc per part de senyors francesos. Els croats van assetjar Carcassona l'agost del 1209 i, malgrat la resistència inicial de la ciutat i les negociacions del rei d'Aragó per aconseguir la pau, la ciutat finalment es va rendir. El vescomte va ser fet presoner a traïció i el novembre del mateix any va morir empresonat. El seu únic fill i hereu va passar la seva infància a cura dels comtes de Foix.
Agnès aquell mateix mes de novembre va signar amb Simó de Montfort, cap de la croada contra els albigesos, la seva renúncia als drets que tenia sobre el vescomtat de Carcassona.[5]