Ukupno 76 ekipa iz 52 članice UEFA-e (Lihtenštajn ne organizuje domaće takmičenje) su učestvovale u Ligi prvaka u sezoni 2008/09. Države su raspoređene prema UEFA ligaškim koeficijentima iz 2007. godine rang. Automatski ulazak branioca titule nije korisšten pošto se Manchester United kvalifikovao za grupnu fazu kao prvak Premier lige.
Ispod se nalazi kvalifikaciona šema za Ligu prvaka 2008/09:
Asocijacije 1-3 (Španija, Engleska i Italija) imaju četiri ekipe predstavnice
Asocijacije 4-6 (Francuska, Njemačka i Portugal) imaju tri ekipe predstavnice
Asocijacije 7-15 (Rumunija, Holandija, Rusija, Škotska, Ukrajina, Belgija, Češka Republika, Turska i Grčka) imaju dvije ekipe predstavnice
Asocijacije 16-53 (osim Lihtenštajna) imaju jednu ekipu predstavnicu
Prva kvalifikaciona runda: (28 ekipe)
28 šampiona iz asocijacija 25-53
Druga kvalifikaciona runda: (28 ekipa)
14 pobjednika iz prve kvalifikacione runde
8 šampiona iz asocijacija 17-24 (Švicarska, Norveška, Izrael, Srbija, Danska, Austrija, Poljska i Mađarska)
Utakmice prvog kola Lige prvaka igraju se 15. i 16. jula, a uzvratne utakmice 22. i 23. jula 2008 godine. Pobjednici se direktno kvalificiraju u drugo pretkolo.
Utakmice drugog kola Lige prvaka igraju se 29. i 30. jula, a uzvratne utakmice 5. i 6. augusta 2008 godine. Pobjednici se direktno kvalificiraju u treće pretkolo.
Utakmice trećeg kola Lige prvaka igrale su se 12. i 13. augusta, a uzvratne utakmice 26. i 27. augusta 2008 godine. Pobjednici se direktno kvalificiraju u grupnu fazu Lige prvaka, dok poraženi timovi nastupaju u prvom kolu Kupa UEFA.