PROFILPELAJAR.COM

CTSF
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	1M6D
Identifikatori
Aliasi	CTSF, CATSF, CLN13, katepsin F
Vanjski ID-jevi	OMIM: 603539 MGI: 1861434 HomoloGene: 31194 GeneCards: CTSF
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 11 (čovjek)
Kraj	66,568,879 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 19 (miš)
Kraj	4,910,946 bp
Obrazac RNK ekspresije
	Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• GO:0070122 peptidase activity; • cysteine-type peptidase activity; • hydrolase activity; • cysteine-type endopeptidase activity;
Ćelijska komponenta	• extracellular vesicle; • Lizozom; • lysosomal lumen; • Egzosom; • Vanćelijsko; • collagen-containing extracellular matrix;
Biološki proces	• proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • Proteoliza;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	8722
	56464
	ENSG00000174080
	ENSMUSG00000083282
	Q9UBX1
	Q9R013
	NM_003793
	NM_019861
	NP_003784
	NP_063914
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Katepsin F (EC 3.4.22.41 je enzim iz familije papaina, koji je kod čovjeka kodiran iz gena CTSF.^[5]^[6]^[7]^[8]^[9]^[10]^[11]

Katepsin F, kao rekombinantni enzim, katalizira sledeću hemijsku reakciju:

razlaže sintetske supstrate sa fenilalaninom (Phe) i leucinom (Leu) (u većoj mjeri nego valinom (Val) u P2, sa visokom specifičnošću, sličnom kao i katepsin L.

Katepsini su papainska porodice cistein proteinaza koje predstavljaju glavnu komponentu lizosomnih proteolitskih sistema. U principu, sadrže signalne sekvence, praćene propeptidima, a zatim katalitski aktivnu zrelu regiju. Veoma su dug (ostaci 251 aminokiseline). Prekursor za regiju katepsina F sadrži domene C-kraja koje su slične pro-segmentu katepsina L, sa 50 ostataka fleksibilnog linker peptida, domena N-kraja, izgleda da ima put sličan cistatinskom savijanju. Proregikja katepsin F je jedinstvena u cistein proteaznoj porodici papain u tome što sadrži taj dodatni N-terminalni segment predviđen da dijeli strukturnu sličnosti sa inhibitorima cistein proteaza cistatinske superfamilije C1. Ova cisteinolika domena sadrži neke elemente za koje je poznato da su važne za inhibicijske aktivnosti. CTSF kodira predvidivi protein od 484 aminokiselinae, koji, u signalnom peptidu, sadrži 19 ostataka. Katepsin F sadrži pet potencijalnih lokacija N-glikozilacije, može biti usmjeren na endosomno/lizosomne pregrade preko receptorskog puta manoza 6-fosfata. Gen za katepsin F se sveprisutno ispoljava, a mapiran je na hromosomu 11: *pozicija 11q13, u neposrednoj blizini gena koji kodira katepsin W.

Također pogledajte

Reference

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000174080 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000083282 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Cornish-Bowden A. (2004): Fundamentals of enzyme kinetics, 3rd Ed. Portland Press. ISBN 9781855781580; ISBN 1855781581.
^ Međedović S., Maslić E., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 2. Svjetlost, Sarajevo, ISBN 9958-10-222-6.
^ Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 9958-9344-1-8.
^ Santamaría, I., Velasco, G., Pendás, A.M., Paz, A. and López-Otín, C. (1999). "Molecular cloning and structural and functional chararcterization of cathepsin F, a new cysteine proteinase of the papain family with a long propeptide domain". J. Biol. Chem. 274: 13800–13809. PMID 10318784.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)
^ Nägler, D.K. Sulea, T. and Ménard, R. (1999). "Full length cDNA of human cathepsin F predicts the presence of a cystatin domain at the N-terminus of the cysteine protease zymogen". Biochem. Biophys. Res. Commun. 257: 313–318. PMID 10198209.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)
^ Wex, T., Levy, B., Wex, H. and Brömme, D. (1999). "Human cathepsins F and W: A new subgroup of cathepsins". Biochem. Biophys. Res. Commun. 259: 401–407. PMID 10362521.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)
^ Wang, B., Shi, G.-P., Yao, P.M., Li, Z., Chapman, H.A. and Brömme, D. (1998). "Human cathepsin F. Molecular cloning, functional expression, tissue localization, and enzymatic characterization". J. Biol. Chem. 273: 32000–32008. PMID 9822672.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)

Vanjski linkovi

Cathepsin F na US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

Logo Commonsa

Cathepsin F na Wikimedia Commonsu.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000174080 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000083282 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[5] Cornish-Bowden A. (2004): Fundamentals of enzyme kinetics, 3rd Ed. Portland Press. ISBN 9781855781580; ISBN 1855781581.

[6] Međedović S., Maslić E., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 2. Svjetlost, Sarajevo, ISBN 9958-10-222-6.

[7] Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 9958-9344-1-8.

[8] Santamaría, I., Velasco, G., Pendás, A.M., Paz, A. and López-Otín, C. (1999). "Molecular cloning and structural and functional chararcterization of cathepsin F, a new cysteine proteinase of the papain family with a long propeptide domain". J. Biol. Chem. 274: 13800–13809. PMID 10318784.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)

[9] Nägler, D.K. Sulea, T. and Ménard, R. (1999). "Full length cDNA of human cathepsin F predicts the presence of a cystatin domain at the N-terminus of the cysteine protease zymogen". Biochem. Biophys. Res. Commun. 257: 313–318. PMID 10198209.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)

[10] Wex, T., Levy, B., Wex, H. and Brömme, D. (1999). "Human cathepsins F and W: A new subgroup of cathepsins". Biochem. Biophys. Res. Commun. 259: 401–407. PMID 10362521.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)

[11] Wang, B., Shi, G.-P., Yao, P.M., Li, Z., Chapman, H.A. and Brömme, D. (1998). "Human cathepsin F. Molecular cloning, functional expression, tissue localization, and enzymatic characterization". J. Biol. Chem. 273: 32000–32008. PMID 9822672.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]