Informatika mišjeg genoma (MGI) je besplatna mrežna baza podataka i bioinformatički resurs, čiji domaćin je „Jacksomova laboratorija“ (The Jackson Laboratory), a finansiraju je Nacionalni institut za istraživanje ljudskog genoma (National Institute of Human Genome Research) (NHGRI), Nacionalni institut za kancer (National Institute of Cancer) (NCI) i Eunice Kennedy Shriver Nacionalni institut za dječje zdravlje i ljudski razvoj (Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development) (NICHD).[1] MGI pruža pristup podacima o genetici, genomici i biologiji laboratorijskog miša, kako bi se olakšalo proučavanje ljudskog zdravlja i bolesti.[2][3] Baza podataka integrira više projekata, s dva najveća doprinosa iz baze podataka genoma miša i baze podataka ekspresije mišjih gena (GXD).[4] Od 2018., MGI sadrži nadgledane podatke iz preko 230.000 publikacija.[5]
MGI resurs prvi put objavljen je na mreži 1994. i predstavlja zbirku podataka, alata i analiza stvorenih i prilagođenih za upotrebu kod laboratorijskih miševa, koji se široko se koriste kao modelni rganizmi. To je "autoritativni izvor službenih imena za mišjegene, alele i sojeve", koji slijede smjernice uspostavljene prema Međunarodnog komiteta za standardiziranu genetičku nomenklaturu za miša.[6] Historija i fokus laboratorija za istraživanje i proizvodnju u laboratoriji Jackson stvara ogromno znanje i dubinu koju istraživači mogu iskoristiti da bi unaprijedili svoja istraživanja. Posvećena zajednica istraživača miševa širom svijeta takođe poboljšava i doprinosi znanju. Ovo je nezamjenjiv alat za svakog istraživača koji koristi miša kao modelni organizam za istraživanja i za istraživače zainteresirane za gene koji dijele homologiju s genima miša. Na web lokaciji MGI takođe su dostupni različiti resursi za podršku istraživanju miša, uključujući kolekcije životinja i besplatan softver za upravljanje kolonijama.[7]
Baza podataka o mišjem genomu
Baza podataka o mišjem genomu
Struktura proteina integrin regulirajućeg faktora 1 protein, prema PDB[8]
Baza podataka o mišjem genomu prikuplja i obrađuje sveobuhvatne fenotipove i funkcionalne napomene za gene i aleleMus musculus.[9] Ovo je projekat koji finansira NHGRI i koji doprinosi bazi podataka iz informatike mišjeg genoma.
Baza podataka o ekspresiji gena resurs je zajednice prikupljanja informacija o razvojnom izražavanju miša.[10]
^Qi D, Blake JA, Kadin JA, Richardson JE, Ringwald M, Eppig JT, Bult CJ (8–11 August 2005). Data integration in the mouse genome informatics (MGI) database. Computational Systems Bioinformatics Conference, 2005. Workshops and Poster Abstracts. IEEE. str. 37–8. doi:10.1109/CSBW.2005.48. ISBN0-7695-2442-7.
