Pretpostavlja se da je epigenetički kod definirajući kod u svakoj eukariotskojćeliji koji se sastoji od specifične epigenetičke modifikacije u svakoj ćeliji. Sastoji se od histonskih modifikacija definiranih histonskim kodom i dodatnih epigenetičkih modifikacija kao što je metilacija DNK. Osnova za epigenetički kod je sistem iznad genetičkog koda jedne ćelije. Dok je kod jedne osobe genetički kod u svakoj ćeliji isti, epigenetički kod je specifičan za tkivo i ćeliju.[1] Epigenetički kod može biti višedimenzijske prirode. Može uključivati bilo koja od triju glavnih ćelijskih makromolekula; naime, DNK (nezavisan od koda), RNK i/ili protein. U nekim trepljarima su također predloženi potencijalni strukturni kodovi.[2]