Араплийска река извира под името Голяма Дервентска река на 484 m н.в. от Дервентските възвишения, на 500 m югозападно от връх Чакърбаба (540 m), разположен на границата с Турция. До село Чернозем, където отдясно се влива най-големият ѝ приток Боялъшка река тече в тясна гориста долина. В началото до село Вълча поляна в западна посока, до село Раздел – в северна, а след това до село Чернозем – в северозападна. След Чернозем долината ѝ се разширява и реката меандрира. Влива отляво в Поповска река от басейна на Тунджа на 98 m н.в., само на 350 m преди устието на последната в Тунджа.
В някои източници е посочено, че Араплийска река е ляв приток на Тунджа, което не е вярно – виж топографска карта Лист от картаK-35-66. Мащаб: 1 : 100 000.
Площта на водосборния басейн на Араплийска река е 351 km2, което представлява 65,9% от водосборния басейн на Поповска река. Основни притоци: → ляв приток, ← десен приток.
