Універсітэт мае пяць кампусаў: кампус Маркуса ў Беэр-Шэве; кампус Давіда Бергмана ў Беэр-Шэве; кампус Давіда Тувіяху ў Беэр-Шэве; кампус Сдэ-Бакер у Негеве і кампус у Эйлаце.
Ён уключае Нацыянальны інстытут біятэхналогій у Негеве, Інстытут нанамаштабнай навукі і тэхналогій імя Ільзы Кац, Інстытут даследаванняў пустыні імя Якаба Блаўштэйна з Міжнароднай школай вывучэння пустыні імя Альберта Каца і Навукова-даследчы інстытут вывучэння Ізраіля і сіянізму імя Бен-Гурыёна.