Johannes Mötsch studied History and Latin Philology from 1970 to 1978 at the Universität Bonn and graduated in 1979. In 1978 he started, as trainee teacher, the preliminary office at the Landeshauptarchiv Koblenz and attended the Archivschule Marburg until 1980. Until 1993 he worked at the Landeshauptarchiv Koblenz and taught in 1989 at the Marburger Archivschule. In 1993 he went to the thuringian Hauptstaatsarchiv Weimar, where he worked until 1997. In the same year he overtook as archive director the management of the Thüringisches Staatsarchiv in Meiningen.
He is a member of the Historische Kommission für Thüringen.
Regesten des Archivs der Grafen von Sponheim 1065–1437, Teil 1-5, bearbeitet von Johannes Mötsch, Landesarchivverwaltung Rheinland - Pfalz, 1987–1991
Geschichtlicher Atlas der Rheinlande, Beiheft V/4: Die Grafschaften Sponheim, von Johannes Mötsch, Köln: Rheinland-Verlag, 1992
Die ältesten Lehnsbücher der Grafen von Henneberg, bearbeitet von Johannes Mötsch und Katharina Witter, Weimar: Böhlau, 1996 - ISBN3-7400-1013-4
Fuldische Frauenklöster in Thüringen: Regesten zur Geschichte der Klöster Allendorf, Kapellendorf und Zella, Rhön, bearb. und eingel. von Johannes Mötsch, München u.a.: Urban und Fischer, 1999 - ISBN3-437-31126-3
Die Wallfahrt zu Grimmenthal: Urkunden, Rechnungen, Mirakelbuch, herausgegeben von Johannes Mötsch, Köln u.a.: Böhlau, 2004 - ISBN3-412-14004-X
Regesten des Archivs der Grafen von Henneberg-Römhild, Teilbände 1 und 2, herausgegeben von Johannes Mötsch, Köln u.a.: Böhlau, 2006 - ISBN978-3-412-35905-8