The following is a list of the 539 communes in the French department of Haute-Saône.

The communes cooperate in the following intercommunalities (as of 2020):^[1]

• Communauté d'agglomération de Vesoul
• Communauté de communes des Combes
• Communauté de communes de la Haute Comté
• Communauté de communes des Hauts du Val de Saône
• Communauté de communes des mille étangs
• Communauté de communes des Monts de Gy
• Communauté de communes du pays d'Héricourt (partly)
• Communauté de communes du pays de Lure
• Communauté de communes du Pays de Luxeuil
• Communauté de communes du Pays de Montbozon et du Chanois
• Communauté de communes du Pays Riolais
• Communauté de communes du Pays de Villersexel (partly)
• Communauté de communes des Quatre Rivières
• Communauté de communes Rahin et Chérimont
• Communauté de communes des Savoir-Faire (partly)
• Communauté de communes Terres de Saône
• Communauté de communes du Triangle Vert
• Communauté de communes Val de Gray
• Communauté de communes du Val Marnaysien (partly)