هذه المقالة يتيمة إذ تصل إليها مقالات أخرى قليلة جدًا. فضلًا، ساعد بإضافة وصلة إليها في مقالات متعلقة بها. (فبراير 2020)

أقيمت مرحلة المجموعات في دوري أبطال آسيا 2006 في الفترةِ من 8 مارس إلى 17 مايو 2006. وتنافس في مرحلة المجموعات 24 فريقا لتحديد المراكز السبعة في مرحلة خروج المغلوب من دوري أبطال آسيا 2006.

الفريق	لعب	ف	ت	خ	أ.له	أ.ع	أ.ف	نقاط
القادسية	6	3	2	1	9	11	−2	11
باختاكور طشقند	6	3	1	2	11	7	+4	10
الاتحاد	6	2	2	2	6	7	−1	8
نادي فولاد خوزستان	6	1	1	4	8	9	−1	4

---

---

---

---

---

الفريق	لعب	ف	ت	خ	أ.له	أ.ع	أ.ف	نقاط
العين	6	4	1	1	10	6	+4	13
الهلال	6	3	1	2	12	7	+5	10
مشعل	6	2	2	2	7	11	−4	8
الميناء	6	0	2	4	6	11	−5	2

---

---

---

---

---

الفريق	لعب	ف	ت	خ	أ.له	أ.ع	أ.ف	نقاط
الكرامة	6	4	0	2	10	11	−1	12
صبا باتري	6	3	1	2	13	8	+5	10
الوحدة	6	2	1	3	14	15	−1	7
الغرافة	6	2	0	4	11	14	−3	6

---

---

---

---

---

الفريق	لعب	ف	ت	خ	أ.له	أ.ع	أ.ف	نقاط
الشباب	6	4	1	1	9	6	+3	13
السد	6	4	1	1	13	5	+8	13
القوة الجوية	6	2	0	4	5	9	−4	6
العربي	6	1	0	5	5	12	−7	3

---

---

---

---

---

الفريق	لعب	ف	ت	خ	أ.له	أ.ع	أ.ف	نقاط
جونبك هيونداي موتورز	6	4	1	1	11	5	+6	13
نادي داليان شيده	6	4	0	2	7	6	+1	12
غامبا أوساكا	6	3	1	2	26	7	+19	10
نادي إس إتش بي دا نانغ	6	0	0	6	1	27	−26	0

---

---

---

---

---

الفريق	لعب	ف	ت	خ	أ.له	أ.ع	أ.ف	نقاط
أولسان هيونداي	2	2	0	0	3	0	+3	6
طوكيو فيردي	2	0	0	2	0	3	−3	0
TTM FC	0	0	0	0	0	0	0	0[ا]
نادي آريما كرونوس	0	0	0	0	0	0	0	0[ا]

الفريق	لعب	ف	ت	خ	أ.له	أ.ع	أ.ف	نقاط
شانغهاي غرينلاند شينهوا	2	2	0	0	7	3	+4	6
Đồng Tâm Long An	2	0	0	2	3	7	−4	0
برسيبورا جايابورا	0	0	0	0	0	0	0	0[ا]
نادي بوريرام يونايتد	0	0	0	0	0	0	0	0[ا]