كأس الاتحاد البحريني لكرة القدم 2008-2009 هي النسخة السادسة من كأس الاتحاد البحريني لكرة القدم. جرت من 24 ديسمبر 2008 إلى 9 فبراير 2009. توج نادي المحرق باللقب بعدما تغلب في المباراة النهائية على النجمة 1-0.^[1]

الفريق	لعب	فاز	تعادل	خسر	له	عليه	الفارق	النقاط
النجمة	4	2	1	1	7	3	+4	7
الأهلي	4	2	1	1	6	4	+2	7
الرفاع الشرقي	4	2	0	2	10	7	+3	6
الاتفاق	4	1	1	2	1	3	-2	4
البديع	4	0	3	1	1	8	-7	3

---

---

---

---

---

الفريق	لعب	فاز	تعادل	خسر	له	عليه	الفارق	النقاط
الرفاع	4	3	1	0	8	2	+6	10
الشباب	4	2	1	1	7	4	+3	7
سترة	4	1	1	2	8	9	-1	4
قلالي	4	1	1	2	4	8	-4	4
الحالة	4	0	2	2	7	11	-4	2

---

---

---

---

---

الفريق	لعب	فاز	تعادل	خسر	له	عليه	الفارق	النقاط
المحرق	4	3	1	0	14	2	+12	10
الحد	4	3	0	1	11	4	+7	9
المنامة	4	2	1	1	5	3	+2	7
التضامن	4	1	0	3	2	13	-11	3
مدينة عيسى	4	0	0	4	0	10	-10	0

---

---

---

---

---

الفريق	لعب	فاز	تعادل	خسر	له	عليه	الفارق	النقاط
البسيتين	3	1	2	0	7	3	+4	5
البحرين	3	1	2	0	5	3	+2	5
المالكية	3	0	3	0	4	4	0	3
الاتحاد	3	0	1	2	2	8	-6	1

---

---

---

---

كأس الاتحاد البحريني بطل 2008-2009
المحرق اللقب الثاني