توفي المطران سمير قفعيتي في 21 أغسطس2015 في سان دييغو في ولاية كاليفورنيا بالولايات المتحدة الأمريكية، ونعى رئيس دولة فلسطين محمود عباس المطران قفعيتي، قائلًا" "إن المطران قفعيتي انتقلت روحه إلى الأمجاد السماوية بعد حياة حافلة بالعمل المخلص والعطاء الموصول في خدمة قضايا العدل والسلام".[5]