لعب دييغو بيريز خلال مسيرته الاحترافية مع 4 أندية في سبعة عشر موسمًا وسجل خلالها 16 هدفًا ضمن 399 مباراة. ولم يفز بأي موسم بالكأس أو بالدوري.
خاض دييغو بيريز مسيرته مع نادي ديفينسور سبورتينغ في موسم 1999 ليلعب معه خمسة مواسم، مشاركًا في 132 مباراة سجل خلالها 12 هدفًا. ثم انتقل إلى نادي بنيارول ما بين عامي 2004 و2005 لمدة موسم واحد، حيث شارك في 13 مباراة سجل خلالها هدفين. لينتقل بعدها إلى نادي موناكو في موسم 2004–05 ليلعب معه ستة مواسم، مشاركًا في 146 مباراة سجل خلالها هدفين أيضًا. ثم انتقل إلى نادي بولونيا في موسم 2010–11 ليلعب معه خمسة مواسم، مشاركًا في 108 مباراة ولم يسجل أي هدف.[4]