نظراً لأن البلعوم الأنفي يعتبر ممرأ هوائياً، تكون ظهارته مشابهة لمخاطية جوف الأنفالتنفسية.
السقف والجدار الخلفي
يشكل سقف البلعوم الأنفي مع الجدار الخلفي سطحاً مائلاً تحت جسم العظم الوتدي. يحوي الجدار الخلفي على بروز يكون واضحاً في سن الطفولة نتيجة وجود تجمع لنسيج لمفاوي يدعى لوزة بلعومية.