لعب هوغو موراليس خلال مسيرته الاحترافية مع 7 أندية في عشرون موسمًا وسجل خلالها 63 هدفًا ضمن 461 مباراة. ولم يفز بأي موسم بالكأس وفاز في موسم واحد بالدوري.
خاض هوغو موراليس مسيرته مع نادي هوراكان في موسم 1990–91 ليلعب معه خمسة مواسم، مشاركًا في 160 مباراة سجل خلالها 23 هدفًا. ثم انتقل إلى نادي لانوس في موسم 1995–96 في المرة الأولى ليلعب معه أربعة مواسم ثم في موسم 2002–03 لمدة موسم واحد، حيث شارك طوالها في 118 مباراة سجل خلالها 18 هدفًا. لينتقل بعدها إلى نادي تينيريفي في موسم 1999–00 ليلعب معه أربعة مواسم، مشاركًا في 89 مباراة سجل خلالها 7 أهداف. ثم انتقل إلى نادي إنديبندينتي في موسم 2003–04 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 16 مباراة سجل خلالها هدفين. هذا وانتقل لاحقًا إلى نادي أتلتيكو ناسيونال في موسم 2004 واستمر معه طيلة ثلاثة مواسم، مشاركًا في 54 مباراة سجل خلالها 8 أهداف. ثم انتقل بعدها إلى نادي ميلوناريوس ما بين عامي 2006 و2007 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 10 مباريات سجل خلالها 3 أهداف. ليعود وينتقل من جديد، لكن هذه المرة إلى نادي أونيفرسيداد كاتوليكا ما بين عامي 2007 و2008 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 14 مباراة سجل خلالها هدفين.[2]
